Планирование научно-исследовательской работы Регионального центра этнополитических исследований ДНЦ РАН осуществляется на основе Перечня приоритетных направлений фундаментальных исследований, утвержденных Президиумом РАН, и Устава Центра, в котором закреплены основные направления научных исследований.

Основные научные направления УРАН РЦЭИ ДНЦ РАН:

1. Обобщение исторического опыта совместной жизнедеятельности народов Северного Кавказа и Дагестана;

2. Исследование социально-экономических, демографических, государственно-правовых аспектов национального развития и межнациональных отношений;

3. Изучение и прогнозирование современных этнополитических, геостратегических процессов в Северо-Кавказском регионе;

4. Разработка проблем развития малочисленных народов, национальных и этнических групп, их специфических потребностей и интересов;

5. Исследование причин социальных и межнациональных конфликтов, средств их предупреждения и разрешения, подготовка прогнозов и рекомендаций органам государственной власти РФ и республик Северного Кавказа по формированию научно обоснованной национальной политики в регионе;

6. Изучение проблем взаимодействия и роли национального и религиозного факторов в общественно-политической жизни республик Северного Кавказа;

7. Федеральный центр и развитие этнополитических процессов в Северокавказском регионе и т.д.